Istraživački tim:
dr Dragana Ignjatović – Micić, šef Laboratorije,
dr Snežana Mladenović Drinić,
dr Ana Nikolić,
dr Danijela Ristić,
dr Marija Kostadinović
dr Jelena Vukadinović
doktorand Manja Božić
Analiza promena na nivou transkriptoma u ranim fazama razvića kukuruza u uslovima niskih temperatura
Primena metoda sekvenciranja nove generacije, NGS (Next Generation Sequencing, NGS), u cilju korišćenja dobijenih podataka za unapređivanje programa oplemenjivanja kukuruza za svojstva bitna za tolerantnost na niske temperature:
- Identifikacija, kvantifikacija i klasifikacija ciljnih RNK molekula
- Predikcija potencijalno novih (eng. novel) RNK molekula
- Određivanje funkcije gena i načina regulacije njihove ekspresije
- Određivanje funkcije nekodirajućih RNK molekula (lncRNA-seq, sRNA-seq i circRNa-seq) i njihovih potencijalnih ciljnih gena
- Definisanje mreža interakcija nekodirajućih i kodirajućih (mRNA-seq) RNK
- Definisanje regulatornih puteva i mehanizama odgovora na stres izazvan niskim temperaturama
- Identifikacija SNP markera koji bi se koristili u programima stvaranja tolerantnih genotipova kukuruza sa ciljem ranije setve radi izbegavanja stresa suše u fazi cvetanja
Evaluacija germplazme kukuruza i soje primenom platformi za genotipizaciju (SNP marker čipovi)
- Utvrđivanje genetičkog diverziteta, strukture populacija i heterotičnih grupa germplazme kukuruza i soje (komercijalnih i genotipova iz Banke gena)
- Planiranje i unapređenje programa oplemenjivanja kroz:
- identifikaciju lokusa za kvantitativna svojstva (QTLs) i selekcije pomoću molekularnih markera
- utvrđivanje pozicije gena od interesa
- stvaranje osnove za genomsku selekciju
Selekcija pomoću molekularnih markera (Marker Assisted Selection – MAS)
- Prevođenje komercijalnih linija kukuruza u cilju stvaranja hibrida sa poželjnim osobinama adaptiranih na umereno klimatsko područje
- Selekcija na kukuruz poboljšanog kvaliteta proteina (Quality Protein Maize – QPM)
- Selekcija na kukuruz povećanog sadržaja β-karotena
- Primena biohemijskih i molekularnih markera u cilju stvaranja sorti soje bez Kunitz tripsin inhibitora u zrelom zrnu
Molekularna karakterizacija genotipova kukuruza i soje SSR markerima
- Određivanje heterotičnih parova i predikcija heterozisa komercijalnih genotipova kukuruza
- Određivanje srodnosti komercijalnih sorti soje
- Procena diverziteta i modela grupisanja germplazme kukuruza i soje, radi korišćenja u programima predoplemenjivanja za različita agronomska i nutritivna svojstva
Nutritivna karakterizacija kukuruza
- Određivanje sadržaja nakronutrijenata (tokoferola, fenolnih kiselina, karotenoida) i mikotoksina primenom HPLC metode u zrnu kukuruza
- Skrining germplazme kukuruza u cilju identifikacije genotipova sa povećanim sadržajem nutritijenata
- Asocijativno mapiranje za nutritivna svojstva zrna kukuruza
- Uticaj primene mineralnih đubriva folijarne prihrane, sistema obrade zemljišta, herbicida, dužine čuvanja i termičke obrade na sadržaj mikronutrijenata
- Uticaj mikronutrijenata na sadržaj mikotoksina i tolerantnost linija i hibrida kukuruza prema patogenima
Molekularno-genetička identifikacija patogenih gljiva žitarica
- Identifikacija vrsta primenom PCR metode na osnovu postojećih markera/prajmera karakterističnih za vrstu
- Identifikacija vrsta sekvenciranjem ciljnih gena